农业科研院所门户网站建设虽然取得一定成效, 但与先进的门户网站建设水平相比, 与群众对科研网站的服务需求日益增长相比, 仍然存在着较大差距, 随着农业科研院所的体制改革以及信息化进程的不断深入, 农业科研院所网站信息化管理也显现出新的问题，主要体现在信息系统使用率低、信息资源缺乏有效管理、安全保障低等方面。
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